Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB5P09067 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXB5P09067 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB5P09067 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB5P09067 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB5P09067 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB5P09067 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB5P09067 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB5P09067 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB5P09067 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB5P09067 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB5P09067 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB5P09067 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB5P09067 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXB5P09067 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB5P09067 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB5P09067 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB5P09067 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB5P09067 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB5P09067 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB5P09067 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXB5P09067 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms