Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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