Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NGFRP08138 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NGFRP08138 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NGFRP08138 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NGFRP08138 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NGFRP08138 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NGFRP08138 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NGFRP08138 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NGFRP08138 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NGFRP08138 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NGFRP08138 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NGFRP08138 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NGFRP08138 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NGFRP08138 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NGFRP08138 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NGFRP08138 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NGFRP08138 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NGFRP08138 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NGFRP08138 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NGFRP08138 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NGFRP08138 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NGFRP08138 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NGFRP08138 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NGFRP08138 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NGFRP08138 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NGFRP08138 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NGFRP08138 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NGFRP08138 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NGFRP08138 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NGFRP08138 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NGFRP08138 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NGFRP08138 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NGFRP08138 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NGFRP08138 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NGFRP08138 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NGFRP08138 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NGFRP08138 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NGFRP08138 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NGFRP08138 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NGFRP08138 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NGFRP08138 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NGFRP08138 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NGFRP08138 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NGFRP08138 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NGFRP08138 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NGFRP08138 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NGFRP08138 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NGFRP08138 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NGFRP08138 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NGFRP08138 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NGFRP08138 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NGFRP08138 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NGFRP08138 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NGFRP08138 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NGFRP08138 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NGFRP08138 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NGFRP08138 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NGFRP08138 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NGFRP08138 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NGFRP08138 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NGFRP08138 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NGFRP08138 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NGFRP08138 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NGFRP08138 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NGFRP08138 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NGFRP08138 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NGFRP08138 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NGFRP08138 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NGFRP08138 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NGFRP08138 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NGFRP08138 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NGFRP08138 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NGFRP08138 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NGFRP08138 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NGFRP08138 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NGFRP08138 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NGFRP08138 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NGFRP08138 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NGFRP08138 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NGFRP08138 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NGFRP08138 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NGFRP08138 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NGFRP08138 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NGFRP08138 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NGFRP08138 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NGFRP08138 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NGFRP08138 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NGFRP08138 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NGFRP08138 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NGFRP08138 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NGFRP08138 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NGFRP08138 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NGFRP08138 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NGFRP08138 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NGFRP08138 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NGFRP08138 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NGFRP08138 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NGFRP08138 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NGFRP08138 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NGFRP08138 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms