Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBBP07437 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBBP07437 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBBP07437 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBBP07437 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBBP07437 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBBP07437 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBBP07437 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBBP07437 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBBP07437 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBBP07437 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBBP07437 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBBP07437 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBBP07437 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBBP07437 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBBP07437 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBBP07437 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBBP07437 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBBP07437 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBBP07437 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBBP07437 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBBP07437 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBBP07437 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBBP07437 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBBP07437 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBBP07437 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBBP07437 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBBP07437 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBBP07437 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBBP07437 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBBP07437 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBBP07437 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBBP07437 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBBP07437 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBBP07437 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBBP07437 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBBP07437 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBBP07437 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBBP07437 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBBP07437 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBBP07437 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBBP07437 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBBP07437 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBBP07437 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBBP07437 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBBP07437 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBBP07437 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBBP07437 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBBP07437 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBBP07437 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBBP07437 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBBP07437 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBBP07437 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBBP07437 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBBP07437 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBBP07437 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBBP07437 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBBP07437 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBBP07437 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBBP07437 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBBP07437 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBBP07437 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBBP07437 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBBP07437 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBBP07437 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBBP07437 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBBP07437 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBBP07437 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBBP07437 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBBP07437 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBBP07437 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBBP07437 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBBP07437 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBBP07437 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBBP07437 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBBP07437 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBBP07437 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBBP07437 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBBP07437 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBBP07437 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBBP07437 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBBP07437 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBBP07437 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBBP07437 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBBP07437 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBBP07437 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBBP07437 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBBP07437 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBBP07437 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBBP07437 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBBP07437 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBBP07437 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBBP07437 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBBP07437 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBBP07437 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBBP07437 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBBP07437 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBBP07437 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBBP07437 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBBP07437 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms