Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CENPBP07199 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CENPBP07199 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
CENPBP07199 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CENPBP07199 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CENPBP07199 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CENPBP07199 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CENPBP07199 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CENPBP07199 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CENPBP07199 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CENPBP07199 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CENPBP07199 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CENPBP07199 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CENPBP07199 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CENPBP07199 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CENPBP07199 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CENPBP07199 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CENPBP07199 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CENPBP07199 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CENPBP07199 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CENPBP07199 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CENPBP07199 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CENPBP07199 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CENPBP07199 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CENPBP07199 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CENPBP07199 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CENPBP07199 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CENPBP07199 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CENPBP07199 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CENPBP07199 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CENPBP07199 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CENPBP07199 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CENPBP07199 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CENPBP07199 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CENPBP07199 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
CENPBP07199 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
CENPBP07199 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
CENPBP07199 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
CENPBP07199 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CENPBP07199 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CENPBP07199 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CENPBP07199 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CENPBP07199 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CENPBP07199 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CENPBP07199 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CENPBP07199 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CENPBP07199 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CENPBP07199 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CENPBP07199 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CENPBP07199 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CENPBP07199 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CENPBP07199 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CENPBP07199 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CENPBP07199 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CENPBP07199 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CENPBP07199 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CENPBP07199 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CENPBP07199 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CENPBP07199 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CENPBP07199 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CENPBP07199 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CENPBP07199 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CENPBP07199 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CENPBP07199 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CENPBP07199 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CENPBP07199 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CENPBP07199 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CENPBP07199 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CENPBP07199 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CENPBP07199 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CENPBP07199 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CENPBP07199 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CENPBP07199 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CENPBP07199 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CENPBP07199 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CENPBP07199 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CENPBP07199 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CENPBP07199 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CENPBP07199 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CENPBP07199 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CENPBP07199 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CENPBP07199 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CENPBP07199 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CENPBP07199 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CENPBP07199 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CENPBP07199 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CENPBP07199 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CENPBP07199 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CENPBP07199 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CENPBP07199 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CENPBP07199 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CENPBP07199 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CENPBP07199 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CENPBP07199 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CENPBP07199 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CENPBP07199 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CENPBP07199 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CENPBP07199 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CENPBP07199 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CENPBP07199 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms