Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOA1P02647 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOA1P02647 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOA1P02647 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOA1P02647 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOA1P02647 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOA1P02647 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOA1P02647 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOA1P02647 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOA1P02647 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOA1P02647 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOA1P02647 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOA1P02647 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOA1P02647 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOA1P02647 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOA1P02647 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOA1P02647 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOA1P02647 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOA1P02647 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOA1P02647 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOA1P02647 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOA1P02647 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOA1P02647 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOA1P02647 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOA1P02647 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOA1P02647 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOA1P02647 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOA1P02647 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOA1P02647 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOA1P02647 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOA1P02647 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOA1P02647 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOA1P02647 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOA1P02647 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOA1P02647 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOA1P02647 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOA1P02647 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOA1P02647 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOA1P02647 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
APOA1P02647 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOA1P02647 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOA1P02647 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOA1P02647 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOA1P02647 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOA1P02647 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOA1P02647 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOA1P02647 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOA1P02647 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOA1P02647 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
APOA1P02647 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOA1P02647 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOA1P02647 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOA1P02647 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOA1P02647 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOA1P02647 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOA1P02647 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOA1P02647 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOA1P02647 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOA1P02647 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOA1P02647 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOA1P02647 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOA1P02647 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOA1P02647 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOA1P02647 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOA1P02647 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOA1P02647 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOA1P02647 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOA1P02647 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOA1P02647 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOA1P02647 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOA1P02647 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOA1P02647 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOA1P02647 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOA1P02647 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOA1P02647 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOA1P02647 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOA1P02647 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOA1P02647 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOA1P02647 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOA1P02647 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOA1P02647 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOA1P02647 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOA1P02647 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOA1P02647 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOA1P02647 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOA1P02647 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOA1P02647 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOA1P02647 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOA1P02647 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOA1P02647 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOA1P02647 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOA1P02647 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOA1P02647 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOA1P02647 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOA1P02647 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOA1P02647 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOA1P02647 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOA1P02647 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOA1P02647 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOA1P02647 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms