Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX58O95786 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX58O95786 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX58O95786 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX58O95786 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX58O95786 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX58O95786 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX58O95786 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX58O95786 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX58O95786 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX58O95786 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX58O95786 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX58O95786 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX58O95786 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX58O95786 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX58O95786 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX58O95786 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX58O95786 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX58O95786 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX58O95786 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX58O95786 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX58O95786 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX58O95786 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX58O95786 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX58O95786 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX58O95786 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX58O95786 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX58O95786 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX58O95786 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX58O95786 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX58O95786 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX58O95786 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX58O95786 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX58O95786 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX58O95786 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX58O95786 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX58O95786 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX58O95786 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX58O95786 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX58O95786 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX58O95786 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX58O95786 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX58O95786 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX58O95786 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX58O95786 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX58O95786 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX58O95786 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX58O95786 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX58O95786 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX58O95786 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX58O95786 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX58O95786 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
DDX58O95786 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX58O95786 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX58O95786 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX58O95786 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX58O95786 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX58O95786 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX58O95786 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX58O95786 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX58O95786 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDX58O95786 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDX58O95786 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
DDX58O95786 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDX58O95786 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
DDX58O95786 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
DDX58O95786 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDX58O95786 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDX58O95786 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDX58O95786 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX58O95786 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX58O95786 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX58O95786 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX58O95786 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX58O95786 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX58O95786 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX58O95786 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX58O95786 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX58O95786 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX58O95786 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX58O95786 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX58O95786 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX58O95786 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX58O95786 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX58O95786 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX58O95786 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX58O95786 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX58O95786 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX58O95786 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX58O95786 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX58O95786 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX58O95786 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX58O95786 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX58O95786 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX58O95786 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX58O95786 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX58O95786 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX58O95786 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX58O95786 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDX58O95786 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms