Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24DO94855 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms