Protein–RNA interactions for Protein: O75817

POP7, Ribonuclease P protein subunit p20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP7O75817 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP7O75817 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP7O75817 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP7O75817 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP7O75817 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP7O75817 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POP7O75817 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP7O75817 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP7O75817 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP7O75817 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP7O75817 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP7O75817 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP7O75817 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP7O75817 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP7O75817 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP7O75817 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP7O75817 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP7O75817 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP7O75817 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP7O75817 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP7O75817 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP7O75817 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP7O75817 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP7O75817 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP7O75817 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP7O75817 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP7O75817 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP7O75817 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP7O75817 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP7O75817 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP7O75817 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP7O75817 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP7O75817 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP7O75817 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP7O75817 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP7O75817 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP7O75817 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP7O75817 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP7O75817 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP7O75817 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP7O75817 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP7O75817 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP7O75817 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP7O75817 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP7O75817 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP7O75817 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POP7O75817 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP7O75817 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP7O75817 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP7O75817 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP7O75817 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP7O75817 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP7O75817 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POP7O75817 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP7O75817 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP7O75817 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP7O75817 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POP7O75817 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP7O75817 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP7O75817 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP7O75817 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP7O75817 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP7O75817 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP7O75817 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP7O75817 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POP7O75817 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP7O75817 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP7O75817 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP7O75817 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP7O75817 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP7O75817 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP7O75817 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP7O75817 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP7O75817 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POP7O75817 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POP7O75817 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP7O75817 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP7O75817 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP7O75817 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP7O75817 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP7O75817 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP7O75817 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP7O75817 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP7O75817 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP7O75817 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP7O75817 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP7O75817 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP7O75817 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP7O75817 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP7O75817 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP7O75817 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP7O75817 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP7O75817 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP7O75817 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP7O75817 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP7O75817 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POP7O75817 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP7O75817 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP7O75817 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP7O75817 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms