Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH16O75309 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH16O75309 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH16O75309 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH16O75309 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH16O75309 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH16O75309 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH16O75309 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH16O75309 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH16O75309 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH16O75309 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH16O75309 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH16O75309 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH16O75309 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH16O75309 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH16O75309 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH16O75309 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH16O75309 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH16O75309 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH16O75309 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH16O75309 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH16O75309 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH16O75309 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH16O75309 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH16O75309 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH16O75309 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH16O75309 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH16O75309 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH16O75309 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH16O75309 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH16O75309 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH16O75309 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH16O75309 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH16O75309 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH16O75309 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH16O75309 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH16O75309 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH16O75309 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH16O75309 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH16O75309 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH16O75309 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH16O75309 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH16O75309 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH16O75309 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH16O75309 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH16O75309 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH16O75309 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH16O75309 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH16O75309 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH16O75309 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH16O75309 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH16O75309 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH16O75309 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH16O75309 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH16O75309 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH16O75309 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH16O75309 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH16O75309 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH16O75309 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH16O75309 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH16O75309 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH16O75309 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH16O75309 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH16O75309 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH16O75309 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH16O75309 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH16O75309 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH16O75309 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH16O75309 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH16O75309 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH16O75309 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH16O75309 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH16O75309 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH16O75309 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH16O75309 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH16O75309 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH16O75309 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH16O75309 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH16O75309 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH16O75309 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH16O75309 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH16O75309 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH16O75309 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH16O75309 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH16O75309 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH16O75309 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH16O75309 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH16O75309 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH16O75309 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH16O75309 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH16O75309 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH16O75309 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH16O75309 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH16O75309 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH16O75309 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH16O75309 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH16O75309 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH16O75309 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH16O75309 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH16O75309 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms