Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNOT3O75175 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms