Protein–RNA interactions for Protein: O60882

MMP20, Matrix metalloproteinase-20, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP20O60882 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP20O60882 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP20O60882 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP20O60882 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP20O60882 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP20O60882 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP20O60882 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP20O60882 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP20O60882 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP20O60882 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMP20O60882 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMP20O60882 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP20O60882 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP20O60882 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP20O60882 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP20O60882 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP20O60882 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP20O60882 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP20O60882 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP20O60882 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP20O60882 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP20O60882 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP20O60882 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP20O60882 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP20O60882 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP20O60882 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP20O60882 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP20O60882 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP20O60882 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP20O60882 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP20O60882 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP20O60882 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP20O60882 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP20O60882 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP20O60882 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP20O60882 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP20O60882 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP20O60882 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP20O60882 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP20O60882 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP20O60882 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP20O60882 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP20O60882 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP20O60882 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP20O60882 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP20O60882 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP20O60882 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP20O60882 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP20O60882 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP20O60882 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP20O60882 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP20O60882 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP20O60882 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP20O60882 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP20O60882 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP20O60882 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP20O60882 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP20O60882 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP20O60882 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP20O60882 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP20O60882 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP20O60882 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP20O60882 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP20O60882 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP20O60882 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP20O60882 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP20O60882 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP20O60882 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP20O60882 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP20O60882 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP20O60882 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP20O60882 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP20O60882 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP20O60882 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP20O60882 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP20O60882 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP20O60882 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP20O60882 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP20O60882 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP20O60882 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP20O60882 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP20O60882 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP20O60882 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP20O60882 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP20O60882 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP20O60882 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP20O60882 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP20O60882 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP20O60882 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP20O60882 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP20O60882 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP20O60882 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP20O60882 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP20O60882 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP20O60882 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP20O60882 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP20O60882 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP20O60882 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP20O60882 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP20O60882 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms