Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEMFO60524 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEMFO60524 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEMFO60524 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEMFO60524 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEMFO60524 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEMFO60524 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEMFO60524 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEMFO60524 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEMFO60524 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEMFO60524 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEMFO60524 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEMFO60524 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEMFO60524 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEMFO60524 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NEMFO60524 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEMFO60524 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEMFO60524 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEMFO60524 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEMFO60524 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEMFO60524 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEMFO60524 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEMFO60524 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEMFO60524 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEMFO60524 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEMFO60524 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEMFO60524 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEMFO60524 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEMFO60524 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEMFO60524 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEMFO60524 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEMFO60524 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEMFO60524 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEMFO60524 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEMFO60524 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEMFO60524 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEMFO60524 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEMFO60524 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEMFO60524 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEMFO60524 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEMFO60524 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEMFO60524 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NEMFO60524 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEMFO60524 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEMFO60524 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEMFO60524 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEMFO60524 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NEMFO60524 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEMFO60524 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEMFO60524 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEMFO60524 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEMFO60524 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEMFO60524 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NEMFO60524 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEMFO60524 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEMFO60524 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEMFO60524 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEMFO60524 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEMFO60524 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEMFO60524 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEMFO60524 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEMFO60524 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEMFO60524 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEMFO60524 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NEMFO60524 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEMFO60524 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NEMFO60524 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEMFO60524 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEMFO60524 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEMFO60524 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEMFO60524 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEMFO60524 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEMFO60524 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEMFO60524 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEMFO60524 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEMFO60524 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEMFO60524 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEMFO60524 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEMFO60524 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEMFO60524 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEMFO60524 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEMFO60524 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEMFO60524 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEMFO60524 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEMFO60524 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEMFO60524 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEMFO60524 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEMFO60524 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEMFO60524 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEMFO60524 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEMFO60524 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEMFO60524 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEMFO60524 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEMFO60524 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEMFO60524 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEMFO60524 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEMFO60524 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEMFO60524 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEMFO60524 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEMFO60524 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms