Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOBOXO60393 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOBOXO60393 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms