Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNG3O60359 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNG3O60359 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms