Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
KIAA0556O60303 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KIAA0556O60303 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC36.63■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC36.6■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
KIAA0556O60303 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms