Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms