Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX1O43933 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX1O43933 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX1O43933 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX1O43933 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX1O43933 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX1O43933 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX1O43933 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX1O43933 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX1O43933 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX1O43933 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX1O43933 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX1O43933 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX1O43933 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX1O43933 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX1O43933 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX1O43933 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX1O43933 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX1O43933 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX1O43933 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX1O43933 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX1O43933 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX1O43933 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX1O43933 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX1O43933 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX1O43933 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX1O43933 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX1O43933 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX1O43933 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX1O43933 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX1O43933 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX1O43933 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX1O43933 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX1O43933 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX1O43933 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX1O43933 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX1O43933 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX1O43933 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX1O43933 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX1O43933 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX1O43933 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX1O43933 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX1O43933 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX1O43933 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX1O43933 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX1O43933 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX1O43933 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX1O43933 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX1O43933 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX1O43933 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX1O43933 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX1O43933 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX1O43933 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX1O43933 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX1O43933 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX1O43933 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX1O43933 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX1O43933 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX1O43933 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX1O43933 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX1O43933 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX1O43933 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX1O43933 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX1O43933 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX1O43933 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX1O43933 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX1O43933 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX1O43933 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX1O43933 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX1O43933 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX1O43933 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX1O43933 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX1O43933 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX1O43933 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX1O43933 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX1O43933 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX1O43933 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX1O43933 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX1O43933 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX1O43933 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX1O43933 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX1O43933 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX1O43933 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX1O43933 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX1O43933 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX1O43933 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX1O43933 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX1O43933 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX1O43933 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX1O43933 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX1O43933 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX1O43933 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX1O43933 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX1O43933 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX1O43933 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX1O43933 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX1O43933 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX1O43933 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX1O43933 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX1O43933 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms