Protein–RNA interactions for Protein: O43791

SPOP, Speckle-type POZ protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOPO43791 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPOPO43791 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPOPO43791 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPOPO43791 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPOPO43791 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPOPO43791 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPOPO43791 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPOPO43791 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPOPO43791 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPOPO43791 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPOPO43791 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPOPO43791 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPOPO43791 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPOPO43791 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPOPO43791 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPOPO43791 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPOPO43791 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPOPO43791 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPOPO43791 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPOPO43791 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SPOPO43791 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPOPO43791 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPOPO43791 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SPOPO43791 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPOPO43791 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPOPO43791 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPOPO43791 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPOPO43791 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPOPO43791 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPOPO43791 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPOPO43791 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPOPO43791 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPOPO43791 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPOPO43791 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPOPO43791 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPOPO43791 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPOPO43791 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPOPO43791 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SPOPO43791 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPOPO43791 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPOPO43791 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPOPO43791 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPOPO43791 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPOPO43791 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPOPO43791 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPOPO43791 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPOPO43791 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPOPO43791 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPOPO43791 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPOPO43791 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPOPO43791 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPOPO43791 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPOPO43791 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPOPO43791 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPOPO43791 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPOPO43791 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPOPO43791 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPOPO43791 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPOPO43791 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPOPO43791 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPOPO43791 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SPOPO43791 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPOPO43791 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPOPO43791 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPOPO43791 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOPO43791 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOPO43791 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOPO43791 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOPO43791 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOPO43791 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOPO43791 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOPO43791 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOPO43791 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOPO43791 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SPOPO43791 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPOPO43791 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPOPO43791 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPOPO43791 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPOPO43791 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SPOPO43791 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPOPO43791 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPOPO43791 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPOPO43791 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPOPO43791 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPOPO43791 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOPO43791 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOPO43791 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOPO43791 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOPO43791 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOPO43791 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOPO43791 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOPO43791 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOPO43791 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOPO43791 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOPO43791 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOPO43791 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOPO43791 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOPO43791 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOPO43791 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOPO43791 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms