Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGTAO43765 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SGTAO43765 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGTAO43765 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGTAO43765 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGTAO43765 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGTAO43765 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGTAO43765 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGTAO43765 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGTAO43765 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGTAO43765 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGTAO43765 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGTAO43765 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGTAO43765 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGTAO43765 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGTAO43765 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGTAO43765 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGTAO43765 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGTAO43765 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SGTAO43765 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SGTAO43765 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGTAO43765 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGTAO43765 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGTAO43765 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGTAO43765 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGTAO43765 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGTAO43765 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGTAO43765 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGTAO43765 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGTAO43765 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGTAO43765 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SGTAO43765 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGTAO43765 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGTAO43765 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGTAO43765 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGTAO43765 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGTAO43765 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGTAO43765 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGTAO43765 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGTAO43765 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGTAO43765 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGTAO43765 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGTAO43765 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGTAO43765 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGTAO43765 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGTAO43765 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGTAO43765 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGTAO43765 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGTAO43765 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGTAO43765 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGTAO43765 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGTAO43765 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGTAO43765 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGTAO43765 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGTAO43765 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGTAO43765 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGTAO43765 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGTAO43765 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGTAO43765 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGTAO43765 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGTAO43765 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGTAO43765 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGTAO43765 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGTAO43765 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGTAO43765 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGTAO43765 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGTAO43765 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGTAO43765 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGTAO43765 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGTAO43765 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGTAO43765 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGTAO43765 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGTAO43765 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGTAO43765 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGTAO43765 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGTAO43765 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGTAO43765 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGTAO43765 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SGTAO43765 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGTAO43765 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGTAO43765 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGTAO43765 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGTAO43765 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGTAO43765 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGTAO43765 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGTAO43765 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGTAO43765 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGTAO43765 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGTAO43765 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGTAO43765 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGTAO43765 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGTAO43765 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGTAO43765 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGTAO43765 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGTAO43765 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SGTAO43765 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGTAO43765 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGTAO43765 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGTAO43765 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGTAO43765 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms