Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms