Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKAB2O43741 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms