Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRID2O43424 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRID2O43424 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRID2O43424 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRID2O43424 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRID2O43424 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRID2O43424 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRID2O43424 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRID2O43424 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRID2O43424 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRID2O43424 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GRID2O43424 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GRID2O43424 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRID2O43424 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRID2O43424 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRID2O43424 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRID2O43424 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRID2O43424 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRID2O43424 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRID2O43424 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRID2O43424 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRID2O43424 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GRID2O43424 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRID2O43424 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRID2O43424 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRID2O43424 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRID2O43424 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRID2O43424 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRID2O43424 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRID2O43424 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRID2O43424 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRID2O43424 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRID2O43424 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRID2O43424 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRID2O43424 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRID2O43424 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRID2O43424 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRID2O43424 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRID2O43424 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRID2O43424 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRID2O43424 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRID2O43424 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRID2O43424 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GRID2O43424 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GRID2O43424 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRID2O43424 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRID2O43424 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRID2O43424 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRID2O43424 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRID2O43424 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRID2O43424 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRID2O43424 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRID2O43424 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRID2O43424 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRID2O43424 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRID2O43424 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRID2O43424 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRID2O43424 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRID2O43424 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRID2O43424 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRID2O43424 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRID2O43424 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRID2O43424 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRID2O43424 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRID2O43424 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRID2O43424 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRID2O43424 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRID2O43424 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRID2O43424 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRID2O43424 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRID2O43424 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRID2O43424 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRID2O43424 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GRID2O43424 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRID2O43424 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GRID2O43424 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRID2O43424 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRID2O43424 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRID2O43424 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRID2O43424 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRID2O43424 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRID2O43424 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRID2O43424 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRID2O43424 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRID2O43424 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRID2O43424 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRID2O43424 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRID2O43424 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRID2O43424 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRID2O43424 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRID2O43424 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRID2O43424 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRID2O43424 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRID2O43424 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRID2O43424 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GRID2O43424 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRID2O43424 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRID2O43424 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRID2O43424 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRID2O43424 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms