Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR1CO15160 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms