Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASKO14936 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASKO14936 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASKO14936 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASKO14936 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASKO14936 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASKO14936 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASKO14936 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASKO14936 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASKO14936 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASKO14936 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASKO14936 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASKO14936 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASKO14936 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASKO14936 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASKO14936 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASKO14936 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASKO14936 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASKO14936 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASKO14936 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CASKO14936 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASKO14936 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASKO14936 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASKO14936 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASKO14936 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASKO14936 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASKO14936 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASKO14936 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASKO14936 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASKO14936 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASKO14936 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASKO14936 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASKO14936 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASKO14936 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASKO14936 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASKO14936 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASKO14936 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASKO14936 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CASKO14936 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CASKO14936 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASKO14936 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASKO14936 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASKO14936 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASKO14936 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASKO14936 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASKO14936 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASKO14936 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASKO14936 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASKO14936 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASKO14936 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASKO14936 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASKO14936 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASKO14936 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASKO14936 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASKO14936 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASKO14936 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASKO14936 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASKO14936 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASKO14936 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CASKO14936 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASKO14936 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASKO14936 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASKO14936 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASKO14936 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASKO14936 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASKO14936 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASKO14936 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASKO14936 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASKO14936 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASKO14936 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASKO14936 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASKO14936 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASKO14936 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASKO14936 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASKO14936 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASKO14936 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASKO14936 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASKO14936 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASKO14936 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASKO14936 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASKO14936 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASKO14936 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASKO14936 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASKO14936 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASKO14936 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASKO14936 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASKO14936 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASKO14936 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASKO14936 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASKO14936 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASKO14936 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASKO14936 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASKO14936 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASKO14936 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASKO14936 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASKO14936 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASKO14936 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASKO14936 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CASKO14936 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASKO14936 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms