Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms