Protein–RNA interactions for Protein: O00501

CLDN5, Claudin-5, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5O00501 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN5O00501 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN5O00501 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN5O00501 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN5O00501 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN5O00501 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN5O00501 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN5O00501 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN5O00501 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN5O00501 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN5O00501 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN5O00501 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN5O00501 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLDN5O00501 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN5O00501 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms