Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TULP1O00294 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TULP1O00294 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TULP1O00294 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TULP1O00294 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TULP1O00294 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TULP1O00294 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TULP1O00294 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TULP1O00294 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TULP1O00294 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TULP1O00294 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TULP1O00294 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TULP1O00294 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TULP1O00294 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TULP1O00294 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TULP1O00294 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TULP1O00294 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TULP1O00294 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TULP1O00294 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TULP1O00294 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TULP1O00294 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TULP1O00294 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TULP1O00294 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TULP1O00294 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TULP1O00294 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TULP1O00294 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TULP1O00294 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TULP1O00294 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TULP1O00294 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TULP1O00294 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TULP1O00294 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TULP1O00294 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TULP1O00294 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TULP1O00294 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TULP1O00294 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TULP1O00294 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TULP1O00294 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TULP1O00294 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TULP1O00294 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TULP1O00294 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TULP1O00294 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TULP1O00294 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TULP1O00294 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TULP1O00294 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TULP1O00294 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TULP1O00294 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TULP1O00294 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TULP1O00294 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TULP1O00294 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TULP1O00294 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TULP1O00294 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TULP1O00294 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TULP1O00294 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TULP1O00294 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TULP1O00294 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TULP1O00294 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TULP1O00294 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TULP1O00294 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TULP1O00294 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TULP1O00294 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TULP1O00294 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TULP1O00294 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TULP1O00294 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TULP1O00294 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TULP1O00294 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TULP1O00294 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TULP1O00294 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TULP1O00294 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP1O00294 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP1O00294 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP1O00294 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP1O00294 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP1O00294 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP1O00294 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP1O00294 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP1O00294 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP1O00294 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP1O00294 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP1O00294 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP1O00294 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TULP1O00294 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TULP1O00294 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TULP1O00294 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TULP1O00294 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TULP1O00294 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TULP1O00294 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TULP1O00294 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TULP1O00294 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TULP1O00294 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TULP1O00294 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TULP1O00294 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TULP1O00294 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TULP1O00294 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TULP1O00294 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TULP1O00294 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TULP1O00294 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TULP1O00294 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TULP1O00294 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TULP1O00294 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TULP1O00294 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms