Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QR89 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QR89 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QR89 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QR89 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QR89 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QR89 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QR89 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QR89 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QR89 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QR89 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QR89 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QR89 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QR89 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QR89 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QR89 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QR89 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QR89 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QR89 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QR89 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QR89 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
J3QR89 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
J3QR89 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
J3QR89 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
J3QR89 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
J3QR89 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
J3QR89 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QR89 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QR89 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QR89 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QR89 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QR89 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QR89 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QR89 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QR89 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QR89 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QR89 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QR89 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QR89 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QR89 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QR89 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QR89 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QR89 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QR89 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QR89 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QR89 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QR89 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QR89 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QR89 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QR89 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QR89 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QR89 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QR89 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QR89 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3QR89 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3QR89 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3QR89 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3QR89 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3QR89 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3QR89 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3QR89 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3QR89 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3QR89 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3QR89 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3QR89 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3QR89 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3QR89 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
J3QR89 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3QR89 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QR89 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QR89 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QR89 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QR89 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QR89 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QR89 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QR89 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QR89 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QR89 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QR89 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QR89 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QR89 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QR89 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QR89 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QR89 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QR89 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QR89 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QR89 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QR89 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QR89 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QR89 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QR89 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QR89 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QR89 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QR89 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QR89 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QR89 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QR89 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QR89 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QR89 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QR89 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms