Protein–RNA interactions for Protein: I3L4J1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L4J1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
I3L4J1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
I3L4J1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
I3L4J1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
I3L4J1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
I3L4J1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
I3L4J1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
I3L4J1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
I3L4J1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
I3L4J1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
I3L4J1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
I3L4J1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
I3L4J1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
I3L4J1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
I3L4J1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
I3L4J1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
I3L4J1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
I3L4J1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
I3L4J1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
I3L4J1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
I3L4J1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
I3L4J1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
I3L4J1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
I3L4J1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
I3L4J1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
I3L4J1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
I3L4J1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
I3L4J1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
I3L4J1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
I3L4J1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
I3L4J1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
I3L4J1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
I3L4J1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
I3L4J1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
I3L4J1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
I3L4J1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
I3L4J1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
I3L4J1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
I3L4J1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
I3L4J1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
I3L4J1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
I3L4J1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
I3L4J1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
I3L4J1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
I3L4J1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
I3L4J1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
I3L4J1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
I3L4J1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
I3L4J1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
I3L4J1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
I3L4J1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
I3L4J1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
I3L4J1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
I3L4J1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
I3L4J1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
I3L4J1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
I3L4J1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
I3L4J1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
I3L4J1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
I3L4J1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
I3L4J1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
I3L4J1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
I3L4J1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
I3L4J1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
I3L4J1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
I3L4J1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
I3L4J1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
I3L4J1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
I3L4J1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
I3L4J1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
I3L4J1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
I3L4J1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
I3L4J1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
I3L4J1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
I3L4J1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
I3L4J1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
I3L4J1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
I3L4J1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
I3L4J1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
I3L4J1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
I3L4J1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
I3L4J1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
I3L4J1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
I3L4J1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
I3L4J1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
I3L4J1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
I3L4J1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
I3L4J1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
I3L4J1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
I3L4J1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
I3L4J1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
I3L4J1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
I3L4J1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
I3L4J1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
I3L4J1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
I3L4J1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
I3L4J1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
I3L4J1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
I3L4J1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
I3L4J1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms