Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms