Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
H3BQV1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
H3BQV1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
H3BQV1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
H3BQV1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
H3BQV1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
H3BQV1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
H3BQV1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
H3BQV1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
H3BQV1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
H3BQV1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
H3BQV1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
H3BQV1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
H3BQV1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
H3BQV1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
H3BQV1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
H3BQV1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
H3BQV1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
H3BQV1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
H3BQV1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
H3BQV1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
H3BQV1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
H3BQV1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
H3BQV1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
H3BQV1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H3BQV1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H3BQV1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
H3BQV1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
H3BQV1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H3BQV1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H3BQV1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H3BQV1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H3BQV1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
H3BQV1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
H3BQV1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
H3BQV1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
H3BQV1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
H3BQV1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
H3BQV1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
H3BQV1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
H3BQV1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
H3BQV1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
H3BQV1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H3BQV1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
H3BQV1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H3BQV1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
H3BQV1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
H3BQV1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
H3BQV1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
H3BQV1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
H3BQV1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H3BQV1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H3BQV1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H3BQV1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H3BQV1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
H3BQV1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
H3BQV1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
H3BQV1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
H3BQV1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
H3BQV1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
H3BQV1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
H3BQV1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
H3BQV1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
H3BQV1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
H3BQV1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
H3BQV1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
H3BQV1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
H3BQV1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
H3BQV1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
H3BQV1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
H3BQV1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
H3BQV1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
H3BQV1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
H3BQV1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
H3BQV1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
H3BQV1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
H3BQV1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
H3BQV1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
H3BQV1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
H3BQV1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
H3BQV1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
H3BQV1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
H3BQV1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
H3BQV1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
H3BQV1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
H3BQV1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
H3BQV1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
H3BQV1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
H3BQV1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
H3BQV1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
H3BQV1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
H3BQV1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
H3BQV1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
H3BQV1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
H3BQV1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
H3BQV1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
H3BQV1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
H3BQV1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
H3BQV1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
H3BQV1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms