Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F8VP50 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
F8VP50 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
F8VP50 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F8VP50 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F8VP50 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F8VP50 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F8VP50 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
F8VP50 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
F8VP50 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
F8VP50 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
F8VP50 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
F8VP50 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
F8VP50 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
F8VP50 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
F8VP50 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
F8VP50 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
F8VP50 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
F8VP50 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
F8VP50 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
F8VP50 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
F8VP50 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
F8VP50 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
F8VP50 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
F8VP50 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
F8VP50 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
F8VP50 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
F8VP50 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
F8VP50 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
F8VP50 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
F8VP50 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
F8VP50 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
F8VP50 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
F8VP50 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
F8VP50 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
F8VP50 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
F8VP50 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
F8VP50 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
F8VP50 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
F8VP50 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
F8VP50 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
F8VP50 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
F8VP50 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
F8VP50 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
F8VP50 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
F8VP50 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
F8VP50 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
F8VP50 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
F8VP50 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
F8VP50 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
F8VP50 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
F8VP50 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
F8VP50 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
F8VP50 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
F8VP50 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
F8VP50 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
F8VP50 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
F8VP50 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
F8VP50 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
F8VP50 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
F8VP50 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
F8VP50 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
F8VP50 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
F8VP50 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
F8VP50 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
F8VP50 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
F8VP50 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
F8VP50 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
F8VP50 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
F8VP50 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
F8VP50 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
F8VP50 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
F8VP50 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
F8VP50 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
F8VP50 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
F8VP50 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
F8VP50 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
F8VP50 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
F8VP50 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
F8VP50 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
F8VP50 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
F8VP50 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
F8VP50 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
F8VP50 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
F8VP50 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
F8VP50 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
F8VP50 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F8VP50 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F8VP50 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F8VP50 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
F8VP50 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F8VP50 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
F8VP50 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
F8VP50 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
F8VP50 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
F8VP50 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F8VP50 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F8VP50 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
F8VP50 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
F8VP50 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms