Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO5BA8MYB1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCO5BA8MYB1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms