Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A8MVJ9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A8MVJ9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A8MVJ9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A8MVJ9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A8MVJ9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A8MVJ9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A8MVJ9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A8MVJ9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A8MVJ9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
A8MVJ9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A8MVJ9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A8MVJ9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
A8MVJ9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A8MVJ9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A8MVJ9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A8MVJ9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A8MVJ9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A8MVJ9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A8MVJ9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A8MVJ9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A8MVJ9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A8MVJ9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A8MVJ9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A8MVJ9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A8MVJ9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
A8MVJ9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
A8MVJ9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
A8MVJ9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A8MVJ9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A8MVJ9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A8MVJ9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A8MVJ9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A8MVJ9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A8MVJ9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A8MVJ9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A8MVJ9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A8MVJ9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A8MVJ9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A8MVJ9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A8MVJ9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A8MVJ9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A8MVJ9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A8MVJ9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A8MVJ9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A8MVJ9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A8MVJ9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A8MVJ9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A8MVJ9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A8MVJ9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A8MVJ9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A8MVJ9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A8MVJ9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A8MVJ9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A8MVJ9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A8MVJ9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A8MVJ9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A8MVJ9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A8MVJ9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A8MVJ9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A8MVJ9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
A8MVJ9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A8MVJ9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A8MVJ9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A8MVJ9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A8MVJ9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A8MVJ9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A8MVJ9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A8MVJ9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A8MVJ9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A8MVJ9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A8MVJ9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A8MVJ9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A8MVJ9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A8MVJ9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
A8MVJ9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A8MVJ9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A8MVJ9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A8MVJ9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A8MVJ9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A8MVJ9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A8MVJ9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
A8MVJ9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
A8MVJ9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
A8MVJ9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A8MVJ9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A8MVJ9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A8MVJ9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A8MVJ9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A8MVJ9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A8MVJ9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A8MVJ9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A8MVJ9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A8MVJ9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A8MVJ9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A8MVJ9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A8MVJ9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A8MVJ9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A8MVJ9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A8MVJ9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms