Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms