Protein–RNA interactions for Protein: A6NLX3

SPDYE4, Speedy protein E4, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE4A6NLX3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPDYE4A6NLX3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPDYE4A6NLX3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPDYE4A6NLX3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDYE4A6NLX3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDYE4A6NLX3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDYE4A6NLX3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDYE4A6NLX3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDYE4A6NLX3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDYE4A6NLX3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDYE4A6NLX3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPDYE4A6NLX3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPDYE4A6NLX3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPDYE4A6NLX3 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SPDYE4A6NLX3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPDYE4A6NLX3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms