Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDR42E2A6NKP2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDR42E2A6NKP2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDR42E2A6NKP2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms