Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS37CA5D8V6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS37CA5D8V6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms