Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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DKK3Q9UBP4 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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DKK3Q9UBP4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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DKK3Q9UBP4 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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