Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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KLHL13Q9P2N7 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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KLHL13Q9P2N7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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KLHL13Q9P2N7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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KLHL13Q9P2N7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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KLHL13Q9P2N7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL13Q9P2N7 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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