Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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HOXC10Q9NYD6 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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HOXC10Q9NYD6 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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HOXC10Q9NYD6 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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HOXC10Q9NYD6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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HOXC10Q9NYD6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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HOXC10Q9NYD6 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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HOXC10Q9NYD6 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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HOXC10Q9NYD6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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