Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ELL3Q9HB65 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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