Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TDRD1Q9BXT4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms