Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms