Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS5

TRMT61B, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT61BQ9BVS5 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMT61BQ9BVS5 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms