Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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