Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RTP4Q96DX8 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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RTP4Q96DX8 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RTP4Q96DX8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RTP4Q96DX8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RTP4Q96DX8 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RTP4Q96DX8 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RTP4Q96DX8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RTP4Q96DX8 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTP4Q96DX8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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