Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms