Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ZKSCAN1-205ENST00000535170 8758 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ACACB-202ENST00000377848 9247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PLEKHA6-202ENST00000414478 5091 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PAX6-245ENST00000638914 7300 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 TNFAIP3-206ENST00000612899 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AC080128.2-201ENST00000641520 11863 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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